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Centro Formazione SAS di Milano / 8 - 10 ottobre
Corso di formazione organizzato da ITB-CNR, in collaborazione con SAS e bioSKILLS  
 

L’iniziativa intende fornire una panoramica sintetica ma rigorosa dei principali metodi di analisi statistica, genetica e bioinformatica applicati alla trascrittomica ed alla genomica. Si tratta di un corso di formazione scientifica, tenuto da ricercatori dell'Istituto di Tecnologie Biomediche del CNR e dell'Università degli Studi di Milano, direttamente coinvolti 'sul campo' con queste tematiche di ricerca; dal punto di vista didattico le analisi saranno condotte utilizzando JMP Genomics che offre un’ampia serie di strumenti di analisi in continuo sviluppo. Il corso fornisce un'introduzione teorica agli argomenti scientifici, seguita da esercitazioni guidate su PC.

La durata del corso è di 20 ore distribuite in 3 giorni.

 
   

Il corso si rivolge a:

  • ricercatori biomedici e biomolecolari, junior e senior, che intendano analizzare dati derivanti
    da esperimenti di tecnologie 'ad alto parallelismo' di trascrittomica e genomica;

  • bioinformatici, biologi computazionali, analisti di dati di laboratorio di ricerca;

  • capigruppo e coordinatori scientifici.

Prerequisito per la partecipazione é una buona conoscenza degli argomenti scientifici oggetto del corso. Gli argomenti trattati nel corso saranno:

  • Utilizzo pratico dell'interfaccia di JMP; principi di statistica univariata e bivariata; inferenza statistica e test; analisi grafica dei dati con JMP; scripting con JSL.

  • Analisi genetica quantitativa: studi di associazione con SNP; analisi di linkage; Quantitative Trait Analysis; analisi di aplotipi; stratificazione della popolazione. Applicazioni analitiche con JMP Genomics.

  • Analisi dati di espressione genica (one color): introduzione al disegno sperimentale, controllo di qualità e normalizzazione dei dati. Gene profiling, classificazione. Strategie di clustering. Pattern discovery. Annotazione funzionale. Workflow dell'analisi con JMP Genomics.

  • Analisi del genoma: variazione del numero di copie. Binning e conversione dei dati. Standardizzazione. Correlazione delle variazioni con feature di annotazione genomica. Workflow dell'analisi con JMP Genomics.

  • Analisi di exon arrays: principi di base, metodi analitici e correlazione con l'annotazione genomica. Workflow dell' analisi con JMP Genomics.

Docenti del corso saranno un gruppo di ricercatori direttamente coinvolti nell'analisi bioinformatica dei dati derivanti da tecnologie ad alto parallelismo.

• Software e principi di analisi statistica: Alessandro Guffanti (organizzatore), Fabio Fuligni: Laboratorio di Sequenziamento Massivo, ITB-CNR, Milano.
• Microarray: Roberta Spinelli, Michela Mattioli, Luca Beltrame, Eleonora Mangano, Patrizia Pinciroli
  Laboratorio di Microarray, ITB-CNR ed Università degli Studi di Milano.
• Analisi genetica quantitativa: Alessandro Orro, Erika Salvi: Laboratorio di Bioinformatica, ITB-CNR,Milano ed Università degli Studi di Milano.

 
 

 Informazioni generali

Data e sede del corso: 8 -10 ottobre 2008 (inizio il primo giorno alle ore 11.00; conclusione l'ultimo giorno alle ore 17.00)
e si svolgerà presso il Centro Formazione SAS di Milano, via C. Darwin 20/22.

Quota di partecipazione:

Aziende, enti, istituzioni pubbliche: Euro 500,00 + IVA (20%) per partecipante.
Aziende private: Euro 1.000,00 + IVA (20%) per partecipante.

Per iscrizioni multiple da parte di una stessa Azienda sarà praticato uno sconto del 20% per il secondo partecipante ed i successivi. La quota comprende il materiale didattico ed i coffee-break. In caso di cancellazione del corso la responsabilità di SAS è limitata al rimborso delle quote di iscrizione pervenute. In caso di rinuncia scritta con preavviso inferiore ai 5 giorni verrà addebitato il 100% della quota di partecipazione.

 
ITB-CNR
bioSKILLS
ISCRIZIONI

Prenotazione telefonica (esclusivamente attraverso
il Servizio Formazione SAS,
al numero 02 831341) alla quale dovrà seguire via fax
(02 83134225) la seguente scheda di iscrizione.
50 Kb  PDF, 50 Kb
Ciascuna edizione prevede un numero limitato di partecipanti
e le iscrizioni saranno accettate nell’ordine cronologico di arrivo.
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Servizio Formazione SAS
Via Carlo Darwin, 20/22
20143 Milano

Telefono Telefono: 02 831 341 r.a.
Fax Fax: 02 831 34 225
Mail e-mail: formazione@ita.sas.com
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